Нужно прописать в конфиге, не в батнике.
При первом запуске программы создается файл конфигурации amd.txt
В нем определяются карты в строках:
"gpu_threads_conf" : [
{ "index" : 0,
"intensity" : 768, "worksize" : 8,
"affine_to_cpu" : false, "strided_index" : 2, "mem_chunk" : 2,
"unroll" : 8, "comp_mode" : true
},
{ "index" : 1,
"intensity" : 768, "worksize" : 8,
"affine_to_cpu" : false, "strided_index" : 2, "mem_chunk" : 2,
"unroll" : 8, "comp_mode" : true
},
Попробуйте:

1. удалить amd.txt. При следующем запуске программы, она пересоздаст его снова. Есть шанс, что карты определятся
2. Если карты по прежнему не определяются, то попробуйте добавить их вручную в amd.txt, скопировав и добавив индекс карты

пример:
"gpu_threads_conf" : [
{ "index" : 0,
"intensity" : 768, "worksize" : 8,
"affine_to_cpu" : false, "strided_index" : 2, "mem_chunk" : 2,
"unroll" : 8, "comp_mode" : true
},
{ "index" : 1,
"intensity" : 768, "worksize" : 8,
"affine_to_cpu" : false, "strided_index" : 2, "mem_chunk" : 2,
"unroll" : 8, "comp_mode" : true
},
{ "index" : 3,
"intensity" : 768, "worksize" : 8,
"affine_to_cpu" : false, "strided_index" : 2, "mem_chunk" : 2,
"unroll" : 8, "comp_mode" : true
},
и четвертую так же.